Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGSM3Q96HU1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGSM3Q96HU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGSM3Q96HU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms