Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN17Q96FV3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN17Q96FV3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN17Q96FV3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN17Q96FV3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms