Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C19orf60Q96EN9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf60Q96EN9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms