Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLIP3Q96DZ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLIP3Q96DZ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP3Q96DZ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms