Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC39Q96DD0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC39Q96DD0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms