Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC11Q96DB2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC11Q96DB2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms