Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC45Q96CN5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC45Q96CN5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC45Q96CN5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC45Q96CN5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC45Q96CN5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC45Q96CN5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms