Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TM4SF18Q96CE8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM4SF18Q96CE8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms