Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC17Q96AE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC17Q96AE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC17Q96AE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC17Q96AE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms