Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UTP4Q969X6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UTP4Q969X6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UTP4Q969X6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms