Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM63Q969Q1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM63Q969Q1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM63Q969Q1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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