Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
PRG4Q92954 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PRG4Q92954 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PRG4Q92954 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
PRG4Q92954 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PRG4Q92954 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms