Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2H4Q92759 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H4Q92759 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H4Q92759 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms