Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORBQ92753 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORBQ92753 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORBQ92753 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORBQ92753 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORBQ92753 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORBQ92753 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORBQ92753 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORBQ92753 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORBQ92753 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORBQ92753 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORBQ92753 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORBQ92753 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORBQ92753 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORBQ92753 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORBQ92753 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORBQ92753 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORBQ92753 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORBQ92753 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORBQ92753 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORBQ92753 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORBQ92753 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORBQ92753 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORBQ92753 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORBQ92753 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORBQ92753 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORBQ92753 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORBQ92753 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORBQ92753 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RORBQ92753 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORBQ92753 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RORBQ92753 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORBQ92753 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RORBQ92753 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RORBQ92753 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORBQ92753 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms