Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNRQ92752 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNRQ92752 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TNRQ92752 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNRQ92752 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNRQ92752 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNRQ92752 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNRQ92752 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNRQ92752 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNRQ92752 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TNRQ92752 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TNRQ92752 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNRQ92752 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNRQ92752 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNRQ92752 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNRQ92752 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNRQ92752 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNRQ92752 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNRQ92752 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TNRQ92752 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TNRQ92752 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNRQ92752 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNRQ92752 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNRQ92752 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNRQ92752 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
TNRQ92752 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNRQ92752 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNRQ92752 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNRQ92752 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNRQ92752 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNRQ92752 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNRQ92752 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNRQ92752 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNRQ92752 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNRQ92752 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TNRQ92752 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNRQ92752 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNRQ92752 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNRQ92752 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TNRQ92752 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TNRQ92752 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TNRQ92752 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNRQ92752 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNRQ92752 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNRQ92752 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNRQ92752 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNRQ92752 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNRQ92752 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNRQ92752 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNRQ92752 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNRQ92752 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TNRQ92752 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TNRQ92752 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNRQ92752 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNRQ92752 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNRQ92752 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TNRQ92752 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNRQ92752 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNRQ92752 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNRQ92752 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
TNRQ92752 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNRQ92752 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNRQ92752 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNRQ92752 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNRQ92752 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TNRQ92752 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNRQ92752 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNRQ92752 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
TNRQ92752 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNRQ92752 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TNRQ92752 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
TNRQ92752 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNRQ92752 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TNRQ92752 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNRQ92752 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNRQ92752 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNRQ92752 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNRQ92752 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TNRQ92752 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNRQ92752 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNRQ92752 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNRQ92752 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNRQ92752 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNRQ92752 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNRQ92752 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNRQ92752 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNRQ92752 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TNRQ92752 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TNRQ92752 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNRQ92752 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms