Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDEM1Q92611 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EDEM1Q92611 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms