Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GATAD2BQ8WXI9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms