Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PYDC1Q8WXC3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYDC1Q8WXC3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms