Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RUFY2Q8WXA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY2Q8WXA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY2Q8WXA3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms