Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SCFD1Q8WVM8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCFD1Q8WVM8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCFD1Q8WVM8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms