Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC7Q8WUI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HDAC7Q8WUI4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms