Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC12Q8WUD4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC12Q8WUD4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC12Q8WUD4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms