Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RP9Q8TA86 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RP9Q8TA86 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RP9Q8TA86 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms