Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF548Q8NEK5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF548Q8NEK5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF548Q8NEK5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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