Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNNM3Q8NE01 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNNM3Q8NE01 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM3Q8NE01 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms