Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBOF1Q8ND07 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BBOF1Q8ND07 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms