Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARRDC4Q8NCT1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARRDC4Q8NCT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARRDC4Q8NCT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARRDC4Q8NCT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms