Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA70

FAM47B, Protein FAM47B, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47BQ8NA70 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM47BQ8NA70 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM47BQ8NA70 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47BQ8NA70 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms