Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC185Q8N715 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC185Q8N715 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms