Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD6BQ8N6M0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD6BQ8N6M0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUD6BQ8N6M0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms