Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTCAP2Q8N6L1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTCAP2Q8N6L1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTCAP2Q8N6L1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTCAP2Q8N6L1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTCAP2Q8N6L1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTCAP2Q8N6L1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTCAP2Q8N6L1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRTCAP2Q8N6L1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRTCAP2Q8N6L1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms