Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVOPQ8N4V2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVOPQ8N4V2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SVOPQ8N4V2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.8 ms