Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VWA5B2Q8N398 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VWA5B2Q8N398 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA5B2Q8N398 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms