Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PELI3Q8N2H9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PELI3Q8N2H9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PELI3Q8N2H9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms