Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCML4Q8N228 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCML4Q8N228 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCML4Q8N228 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCML4Q8N228 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms