Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC13Q8IYE1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC13Q8IYE1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms