Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN4BQ8IWT1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN4BQ8IWT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN4BQ8IWT1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms