Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRSK2Q8IWQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BRSK2Q8IWQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms