Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PASD1Q8IV76 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PASD1Q8IV76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms