Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLD3Q8IV08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLD3Q8IV08 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLD3Q8IV08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms