Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APOBEC3FQ8IUX4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3FQ8IUX4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3FQ8IUX4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOBEC3FQ8IUX4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms