Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ERC1Q8IUD2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ERC1Q8IUD2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERC1Q8IUD2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms