Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHSY1Q86X52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHSY1Q86X52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHSY1Q86X52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms