Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMB4Q86W47 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB4Q86W47 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB4Q86W47 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms