Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX9Q7RTT3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX9Q7RTT3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms