Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RUFY3Q7L099 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RUFY3Q7L099 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUFY3Q7L099 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms