Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 STIM1-210ENST00000528656 581 ntTSL 48.28□□□□□ -1.083e-7■■■■□ 26.5
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SND1Q7KZF4 STIM1-203ENST00000525055 583 ntTSL 47.4□□□□□ -1.223e-7■■■■□ 26.5
SND1Q7KZF4 STIM1-211ENST00000530554 552 ntTSL 47.37□□□□□ -1.233e-7■■■■□ 26.5
SND1Q7KZF4 STIM1-202ENST00000524822 415 ntTSL 55.93□□□□□ -1.463e-7■■■■□ 26.5
SND1Q7KZF4 ATIC-212ENST00000478734 486 ntTSL 25.61□□□□□ -1.513e-7■■■■□ 26.5
SND1Q7KZF4 TMEM63A-207ENST00000487971 488 ntTSL 35.45□□□□□ -1.543e-7■■■■□ 26.5
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SND1Q7KZF4 LGALS3BP-216ENST00000589906 540 ntTSL 313.83□□□□□ -0.23e-35■■■■□ 26.3
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SND1Q7KZF4 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.939e-7■■■■□ 26.3
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SND1Q7KZF4 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-8■■■■□ 26.3
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SND1Q7KZF4 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.561e-323■■■■□ 26.3
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SND1Q7KZF4 ATP6AP2-206ENST00000486558 832 ntTSL 518.23■□□□□ 0.516e-7■■■■□ 26.3
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SND1Q7KZF4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.011e-8■■■■□ 26.3
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SND1Q7KZF4 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-8■■■■□ 26.3
SND1Q7KZF4 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.171e-8■■■■□ 26.3
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SND1Q7KZF4 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.344e-7■■■■□ 26.2
SND1Q7KZF4 SAR1B-209ENST00000508363 3086 ntTSL 26.7□□□□□ -1.344e-7■■■■□ 26.2
SND1Q7KZF4 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.884e-7■■■■□ 26.2
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SND1Q7KZF4 SRPRB-203ENST00000481356 1487 ntTSL 211.44□□□□□ -0.585e-8■■■■□ 26.2
SND1Q7KZF4 SRPRB-202ENST00000466636 917 ntTSL 39.92□□□□□ -0.825e-8■■■■□ 26.2
SND1Q7KZF4 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.356e-10■■■■□ 26.2
SND1Q7KZF4 CLDN1-202ENST00000490800 432 ntTSL 28.13□□□□□ -1.117e-7■■■■□ 26.2
SND1Q7KZF4 ASNS-217ENST00000495255 1678 ntTSL 212.93□□□□□ -0.341e-9■■■■□ 26.1
SND1Q7KZF4 ASNS-207ENST00000437657 745 ntTSL 58.34□□□□□ -1.071e-9■■■■□ 26.1
SND1Q7KZF4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-8■■■■□ 26.1
SND1Q7KZF4 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-8■■■■□ 26.1
SND1Q7KZF4 COCH-211ENST00000557065 654 ntTSL 58.43□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 26.1
SND1Q7KZF4 NPC2-206ENST00000555592 469 ntTSL 518.71■□□□□ 0.592e-9■■■■□ 26.1
SND1Q7KZF4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.866e-8■■■■□ 26
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SND1Q7KZF4 ANG-203ENST00000554073 251 ntTSL 34.11□□□□□ -1.756e-8■■■■□ 26
SND1Q7KZF4 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 26
SND1Q7KZF4 EBP-204ENST00000466461 694 ntTSL 210.14□□□□□ -0.799e-17■■■■□ 26
SND1Q7KZF4 STT3A-203ENST00000525431 552 ntTSL 49.75□□□□□ -0.856e-22■■■■□ 26
SND1Q7KZF4 TMED10-204ENST00000555873 1161 ntTSL 1 (best)13.67□□□□□ -0.226e-8■■■■□ 26
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