Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KIAA1549LQ6ZVL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA1549LQ6ZVL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1549LQ6ZVL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms