Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R3FQ6ZSY5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPP1R3FQ6ZSY5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms