Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN12Q6ZSI9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN12Q6ZSI9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms